Метод тканевых матриц (TMA) основан на создании единого компактного парафинового блока, содержащего набор разнообразных тканей. Срезы такого блока позволяют проводить сравнительные исследования множества образцов на одном предметном стекле и получать результаты ИГХ от десятков до сотен тканевых образцов одновременно. Современные системы ТМА также позволяют отбирать образцы тканей для последующего ПЦР и молекулярного анализа.